يؤمن الصندوق الوطني للضمان الإجتماعي مداخيله المالية عبر مصدرين ، المصدر الأول من الإشتراكات السنوية، التي توازي نسبة 23,5 % من قيمة الأجور، يدفع منها رب العمل نسبة 21,5 % ويتحمل الأجير نسبة ال 2% المتبقية.
اما المصدر الثاني فمن الأموال التي تدفعها الدولة سنوياً بنسبة 25% من قيمة التقديمات الصحية، إضافة الى إشتراكات أجرائها وجزء من من اشتراكات المخاتير والسائقين العموميين.